Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNIP3Q9Y2W7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms