Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHKBQ9Y259 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHKBQ9Y259 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHKBQ9Y259 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms