Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMC3Q9UQE7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMC3Q9UQE7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms