Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNND2Q9UQB3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTNND2Q9UQB3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTNND2Q9UQB3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms