Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNRC6BQ9UPQ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNRC6BQ9UPQ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms