Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
L1RE1Q9UN81 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms