Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC4EQ9ULY5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC4EQ9ULY5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms