Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
INO80Q9ULG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
INO80Q9ULG1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
INO80Q9ULG1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms