Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNL1Q9UK58 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNL1Q9UK58 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNL1Q9UK58 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms