Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MID2Q9UJV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MID2Q9UJV3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MID2Q9UJV3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MID2Q9UJV3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MID2Q9UJV3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MID2Q9UJV3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms