Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA4Q9UI42 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA4Q9UI42 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms