Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC6Q9UBN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms