Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CC2D2AQ9P2K1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CC2D2AQ9P2K1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
CC2D2AQ9P2K1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CC2D2AQ9P2K1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms