Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH2Q9P0N8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MARCH2Q9P0N8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MARCH2Q9P0N8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms