Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GGA3Q9NZ52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GGA3Q9NZ52 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GGA3Q9NZ52 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms