Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOMER3Q9NSC5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
HOMER3Q9NSC5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER3Q9NSC5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms