Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB6BQ9NRW1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6BQ9NRW1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms