Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH2B1Q9NRF2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2B1Q9NRF2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms