Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITM2CQ9NQX7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITM2CQ9NQX7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms