Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRHQ9HD43 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRHQ9HD43 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
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