Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PREBQ9HCU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PREBQ9HCU5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms