Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM16Q9HAZ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDM16Q9HAZ2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms