Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VRTNQ9H8Y1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VRTNQ9H8Y1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms