Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSS3Q9H6R3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSS3Q9H6R3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms