Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pgpep1Q9ESW8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pgpep1Q9ESW8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pgpep1Q9ESW8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms