Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM7Q9C029 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM7Q9C029 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms