Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIFKQ9BYG3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIFKQ9BYG3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms