Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALN1Q9BXU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CALN1Q9BXU9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms