Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDCA7Q9BWT1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDCA7Q9BWT1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDCA7Q9BWT1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms