Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMM29Q9BSF4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms