Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM79Q9BSE2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM79Q9BSE2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms