Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTP3Q9BQQ7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms