Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnf34Q99KR6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnf34Q99KR6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms