Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN18Q99952 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN18Q99952 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms