Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRRX2Q99811 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms