Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDCA3Q99618 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDCA3Q99618 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms