Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LGMNQ99538 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGMNQ99538 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms