Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM209Q96SK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM209Q96SK2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM209Q96SK2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms