Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC115Q96NT0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC115Q96NT0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms