Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPD52L3Q96J77 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms