Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN23Q96B33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN23Q96B33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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