Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALLDQ8WX93 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALLDQ8WX93 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALLDQ8WX93 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms