Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF31Q8WWY3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF31Q8WWY3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms