Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf54Q8WWF1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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