Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1Q8WVP7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMBR1Q8WVP7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMBR1Q8WVP7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms