Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSMCE1Q8WV22 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE1Q8WV22 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE1Q8WV22 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms