Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RHBDD1Q8TEB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD1Q8TEB9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD1Q8TEB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms