Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PATJQ8NI35 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PATJQ8NI35 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PATJQ8NI35 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms