Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT1Q8NF37 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT1Q8NF37 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms