Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIBP2Q8ND30 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIBP2Q8ND30 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms